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正交 RNA 復(fù)制在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)定向進(jìn)化和達(dá)爾文適應(yīng)

哺乳動(dòng)物細(xì)胞的定向進(jìn)化為推進(jìn)合成生物學(xué)應(yīng)用提供了一種強(qiáng)大的方法。然而,現(xiàn)有的基于哺乳動(dòng)物的定向進(jìn)化方法面臨巨大的瓶頸,包括宿主基因組干擾、小文庫大小和不受控制的誘變。在這里,我們?cè)O(shè)計(jì)了一個(gè)正交的 α 病毒 RNA 復(fù)制系統(tǒng)來進(jìn)化基于 RNA 的設(shè)備,從而在增殖的哺乳動(dòng)物細(xì)胞中實(shí)現(xiàn) RNA 復(fù)制酶輔助連續(xù)進(jìn)化 (REPLACE)。該系統(tǒng)通過復(fù)制酶限制的復(fù)制和誘導(dǎo)誘變模式產(chǎn)生一個(gè)大型的、連續(xù)多樣化的復(fù)制 RNA 文庫。使用 REPLACE,我們?cè)O(shè)計(jì)了熒光蛋白和轉(zhuǎn)錄因子。值得注意的是,配備 REPLACE 的細(xì)胞可以經(jīng)歷達(dá)爾文適應(yīng),使它們能夠響應(yīng)細(xì)胞外源性和細(xì)胞內(nèi)在挑戰(zhàn)而進(jìn)化??偟膩碚f,這項(xiàng)工作為通過定向進(jìn)化推進(jìn)哺乳動(dòng)物合成生物學(xué)和細(xì)胞工程應(yīng)用建立了一個(gè)強(qiáng)大的平臺(tái)。

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